数学専攻では、所定の単位を修得し、必要な研究指導を受け、修士論文の審査および最終試験に合格した者は、以下の能力を身につけており、地域社会や国際社会に貢献できる資質があると判断され、修士（理学）の学位が授与される。

1. 数学を体系的に理解できる。
2. 研究結果を修士論文としてまとめ、口頭発表できる。
3. 中学校・高等学校の教員として、高度な専門的知識を身につけて教育・指導ができる。または、統計数学・計算数学をベースとして、自然現象あるいは社会現象の数理的な解析ができる。

物質科学専攻では、提出した修士論文と最終試験に合格し、物質科学専攻のカリキュラムにおいて必要単位を修得した者は修士（理学）の学位が授与される。
修士論文審査は研究テーマの妥当性、意義、方法、展開、結果、論文の記載等に関して定められた基準に基づいて行なわれ、合否を決定する。
最終試験は論文発表と質疑応答により合否を決定する。
 

数学専攻では、理学部数学科で取得した数学の一般知識を前提として担当教員が世界に発信するレベルを目指した研究指導を行うとともに、地域社会や国際社会に多大な貢献が出来る資質を持った専門職業人の養成のための講義科目を配置しています。カリキュラムは代数学・幾何学・解析学・応用数学・数理科学・社会数理の6分野から構成されています。

物質科学専攻では、高度に専門的なコンピュータスキルをもつ物質科学技術者を目指す特色あるカリキュラムポリシーを設定している。

1. 全院生がコンピュータに精通することを前提とし、情報科学部門の６科目のうち４科目を必修にしている。これにより、進路の可能性を拡げ、地域社会および国際社会に貢献し得る有為な高度専門職業人として活躍できる道を創る。
2. 修士論文研究と特論科目では、それぞれが専門とする分野においてスペシャリストとして高度な知識と技能の修得を目指す。
3. 技術者としての視野をひろげる、サイエンスビジネスセミナーが必修科目に置かれている。