薬学研究科博士課程（博士後期課程）における修了要件と学位授与の方針は、各課程ともに本学の定める修業年限以上在学し、「MUKOGAWA COMPASS」に基づく資質や能力を身につけた上で、論文審査および試験に合格することで課程修了が認定され、それぞれの学位が授与される仕組みとなっています。
　薬学専攻博士課程（薬学）では、所定の履修方法に従って28単位以上を修得し、論文審査および試験に合格した者に博士（薬学）の学位を授与します。
　薬科学専攻博士後期課程（薬科学）では、所定の履修方法に従って16単位以上を修得し、論文審査および試験に合格した者に博士（薬科学）の学位を授与します。
　薬科学専攻博士後期課程（応用薬科学）では、所定の履修方法に従って16単位以上を修得し、論文審査および試験に合格した者に博士（応用薬科学）の学位を授与します。

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　薬学専攻博士課程（薬学・臨床薬学）のカリキュラム・ポリシーは、高い研究能力を持つ薬剤師や自立した教育研究者の育成を目指します。講義で高度な臨床知識を定着させ、演習で研究手技や問題解決力を醸成。複数指導体制での論文作成研究を経て、博士論文で学修成果を総括評価します。
　薬科学専攻（薬科学）では、 医薬品や化粧品、健康食品の創製・開発を担う専門職業人や研究者を育成します 。複数分野の指導教授による指導体制や研究室ローテーション、外部機関との連携を通じ、柔軟な研究能力を育成します。演習と論文研究の連動や十分な討論で理解を深め、提出された博士論文で学修成果を総括評価します。
　薬科学専攻（応用薬科学） 医薬品、化粧品、サプリメント等の応用・臨床研究における高度な専門職業人や研究者を育成します 。複数教授による指導体制、研究室ローテーション、外部医療・研究機関との連携で柔軟な研究能力を養います 。演習と論文作成研究の有機的関連や討論を重視し、博士論文により成果を総括評価します 。

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